El gran objetivo de la Educación Secundaria en San José es dar una formación intelectual rigurosa, favorecer el desarrollo de las habilidades vitales y fomentar el pensamiento crítico, esencial en una edad donde se reafirma la propia personalidad. Es un momento especialmente importante para descubrir los propios talentos, reforzar el autoconcepto positivo y potenciar la capacidad de esfuerzo que les permitirá empezar su camino hacia el mundo laboral.

La ESO es una etapa para consolidar las competencias adquiridas en Primaria. En el ámbito académico, los tres puntos clave son:

· Aprendizaje interdisciplinar y por proyectos en algunas áreas.
· Investigación rigurosa y gestión autónoma de la información.
· Uso de metodologías activas de trabajo, tanto individual como cooperativo.